MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 83796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008750	T	6	6	75	80	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008750	TGA	2	6	126	131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008750	CAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596834
4	NC_008750	GAC	2	6	181	186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596834
5	NC_008750	CAG	2	6	207	212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596834
6	NC_008750	ATGG	2	8	246	253	25 %	25 %	50 %	0 %	120596834
7	NC_008750	T	6	6	333	338	0 %	100 %	0 %	0 %	120596834
8	NC_008750	GTC	2	6	388	393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596834
9	NC_008750	GCCC	2	8	413	420	0 %	0 %	25 %	75 %	120596834
10	NC_008750	TGCTAA	2	12	500	511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	120596834
11	NC_008750	TCG	2	6	553	558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596834
12	NC_008750	TGG	2	6	614	619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596834
13	NC_008750	ATT	2	6	632	637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596834
14	NC_008750	TGG	2	6	644	649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596834
15	NC_008750	TTG	2	6	672	677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596834
16	NC_008750	ATC	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596834
17	NC_008750	AAT	2	6	705	710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596834
18	NC_008750	AAT	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596834
19	NC_008750	GAA	2	6	789	794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596834
20	NC_008750	TAC	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596834
21	NC_008750	AAG	2	6	871	876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596834
22	NC_008750	TTC	2	6	879	884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596834
23	NC_008750	CTTG	2	8	899	906	0 %	50 %	25 %	25 %	120596834
24	NC_008750	ACC	2	6	913	918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596834
25	NC_008750	ATT	2	6	921	926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596834
26	NC_008750	TTGG	2	8	988	995	0 %	50 %	50 %	0 %	120596834
27	NC_008750	AG	3	6	1064	1069	50 %	0 %	50 %	0 %	120596834
28	NC_008750	CTT	2	6	1097	1102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596834
29	NC_008750	CGTG	2	8	1127	1134	0 %	25 %	50 %	25 %	120596834
30	NC_008750	TAC	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596834
31	NC_008750	TGT	2	6	1312	1317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596834
32	NC_008750	CG	3	6	1340	1345	0 %	0 %	50 %	50 %	120596834
33	NC_008750	TAAC	2	8	1381	1388	50 %	25 %	0 %	25 %	120596834
34	NC_008750	TGG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596834
35	NC_008750	CAC	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596834
36	NC_008750	AG	3	6	1478	1483	50 %	0 %	50 %	0 %	120596834
37	NC_008750	AGA	2	6	1496	1501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596834
38	NC_008750	TCT	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596834
39	NC_008750	CT	3	6	1675	1680	0 %	50 %	0 %	50 %	120596835
40	NC_008750	TTG	2	6	1713	1718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596835
41	NC_008750	GAA	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596835
42	NC_008750	ACA	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596835
43	NC_008750	AAG	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596835
44	NC_008750	ATA	2	6	1836	1841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596835
45	NC_008750	TGC	2	6	1848	1853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596835
46	NC_008750	AGA	2	6	1894	1899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596835
47	NC_008750	TTA	2	6	2011	2016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596835
48	NC_008750	GC	3	6	2056	2061	0 %	0 %	50 %	50 %	120596835
49	NC_008750	GTG	2	6	2391	2396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596835
50	NC_008750	GAA	2	6	2453	2458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596835
51	NC_008750	ATC	2	6	2468	2473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596835
52	NC_008750	CAAT	2	8	2488	2495	50 %	25 %	0 %	25 %	120596835
53	NC_008750	GAT	2	6	2555	2560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596835
54	NC_008750	TGAT	2	8	2574	2581	25 %	50 %	25 %	0 %	120596835
55	NC_008750	GAA	2	6	2615	2620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596835
56	NC_008750	ATGT	2	8	2627	2634	25 %	50 %	25 %	0 %	120596835
57	NC_008750	CGC	2	6	2705	2710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008750	CCAT	2	8	2751	2758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008750	TAT	2	6	2804	2809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008750	ATTT	2	8	2979	2986	25 %	75 %	0 %	0 %	120596836
61	NC_008750	CGTT	2	8	3000	3007	0 %	50 %	25 %	25 %	120596836
62	NC_008750	TAA	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596836
63	NC_008750	GC	3	6	3081	3086	0 %	0 %	50 %	50 %	120596836
64	NC_008750	TCG	2	6	3314	3319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596836
65	NC_008750	ACT	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596836
66	NC_008750	ATT	2	6	3677	3682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596836
67	NC_008750	ACA	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596836
68	NC_008750	GAT	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596836
69	NC_008750	CTG	2	6	3853	3858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596836
70	NC_008750	AC	3	6	3875	3880	50 %	0 %	0 %	50 %	120596836
71	NC_008750	GA	3	6	3941	3946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008750	ATA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596837
73	NC_008750	TTC	2	6	3972	3977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596837
74	NC_008750	CGA	2	6	4044	4049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596837
75	NC_008750	CAT	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596837
76	NC_008750	AGT	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
77	NC_008750	TTCTGT	2	12	4155	4166	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	120596837
78	NC_008750	GAT	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
79	NC_008750	GAA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596837
80	NC_008750	GCA	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596837
81	NC_008750	TTA	2	6	4232	4237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596837
82	NC_008750	CGG	2	6	4254	4259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596837
83	NC_008750	GAT	2	6	4267	4272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
84	NC_008750	TGG	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596837
85	NC_008750	TCG	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596837
86	NC_008750	TGAT	2	8	4565	4572	25 %	50 %	25 %	0 %	120596837
87	NC_008750	TCG	2	6	4625	4630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596837
88	NC_008750	ATT	2	6	4631	4636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596837
89	NC_008750	TAA	2	6	4644	4649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596837
90	NC_008750	GAC	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596837
91	NC_008750	CAA	2	6	4764	4769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596837
92	NC_008750	TGG	2	6	4785	4790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596837
93	NC_008750	CAA	2	6	4833	4838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596837
94	NC_008750	GAT	2	6	4891	4896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
95	NC_008750	AGTGA	2	10	4981	4990	40 %	20 %	40 %	0 %	120596837
96	NC_008750	CCG	2	6	5048	5053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596837
97	NC_008750	GCCCGT	2	12	5089	5100	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120596837
98	NC_008750	GCG	2	6	5104	5109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596837
99	NC_008750	CGT	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596837
100	NC_008750	GGT	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596837
101	NC_008750	CTG	2	6	5234	5239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596837
102	NC_008750	TGT	2	6	5336	5341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596837
103	NC_008750	AAG	2	6	5348	5353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596837
104	NC_008750	CGA	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596837
105	NC_008750	CAT	4	12	5430	5441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596837
106	NC_008750	CTT	3	9	5490	5498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596837
107	NC_008750	ATTG	2	8	5514	5521	25 %	50 %	25 %	0 %	120596837
108	NC_008750	GCC	2	6	5547	5552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596837
109	NC_008750	TTG	2	6	5732	5737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596837
110	NC_008750	AGC	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596837
111	NC_008750	TGA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
112	NC_008750	TGG	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596837
113	NC_008750	GTATT	2	10	5887	5896	20 %	60 %	20 %	0 %	120596837
114	NC_008750	ACTA	2	8	5971	5978	50 %	25 %	0 %	25 %	120596837
115	NC_008750	TTC	2	6	5995	6000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596837
116	NC_008750	GCG	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596837
117	NC_008750	GAA	2	6	6058	6063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596837
118	NC_008750	GGC	2	6	6064	6069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596837
119	NC_008750	GTG	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596837
120	NC_008750	AAG	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596837
121	NC_008750	TGA	2	6	6255	6260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
122	NC_008750	GTT	2	6	6279	6284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596837
123	NC_008750	TGT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008750	TGAT	2	8	6380	6387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008750	ATT	2	6	6427	6432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008750	AGC	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008750	TAT	2	6	6456	6461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008750	GTT	2	6	6462	6467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008750	TAA	2	6	6588	6593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596838
130	NC_008750	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596838
131	NC_008750	A	6	6	6681	6686	100 %	0 %	0 %	0 %	120596838
132	NC_008750	CAG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596838
133	NC_008750	GTT	2	6	6718	6723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596838
134	NC_008750	T	6	6	6743	6748	0 %	100 %	0 %	0 %	120596838
135	NC_008750	ATG	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596838
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137	NC_008750	TGA	2	6	6815	6820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596838
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142	NC_008750	ATTT	2	8	7129	7136	25 %	75 %	0 %	0 %	120596838
143	NC_008750	CGT	2	6	7138	7143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596838
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150	NC_008750	TGC	2	6	7505	7510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596838
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162	NC_008750	TTCA	2	8	7915	7922	25 %	50 %	0 %	25 %	120596839
163	NC_008750	TGCT	2	8	7936	7943	0 %	50 %	25 %	25 %	120596839
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